В «Описании документов Виленского центрального архива древних актовых книг. Выпуск X.» от 1 марта 1580 года можно увидеть запись о продаже Попины Войной Васильевичем Линевским и части земель его брата Михаила Васильевича Линевского. Покупателем является Богдан Яцкович Черневский. В документе упоминается действующая православная церковь в Попине.
Из записи в «Актах, издаваемых Виленской археографической комиссией. Т XVIII. Вильна. 1891. с.407» в 1660 году церковь была ограблена.
«Papina» упоминается в списке христианско-католических поселений 1726 года.
Церковь Спаса Преображения была построена из дерева предводителем дворянства Пинского уезда Михаилом Ожешко в 1810 году на месте старой церкви. Храм был построен на каменном фундаменте, рядом с ним была построена деревянная колокольня. Что случилось со старой церковью — неизвестно.
Также есть подтверждение её принадлежности к униатам:
Константин Станкевич сын Якима, * 21.05.1792, в. Пнёвно Пинского у. Учился в школе при Журовецком монастыре базилиан; рукоположен брестским епископом И.-И. Булгаком 1815; святой царя в деревне Папин Кобринского у. 1832-25.02.1837. [575, арк. 62; 576, арк. 69 об.-70; 616; 695].
На сайте Marmon есть копии метрических книг Попинской церкви за 1810-1826 годы, доступны по ссылке.
После отмены унии церковь была передана православным.
Это подтверждается картами Риттиха за 1864 год. И главный пункт церкви находился в Господарстве в. Попино (где сейчас расположена Нова-Попина). Сама Попина, упомянутая выше в записях, находится выше и относится к этому приходу.
Также на картах Шуберта 1866-1887 годов отмечена церковь в Попино.
В 1870 году в церкви на средства местных прихожан был построен новый иконостас. В том же году староста Осовецкой волости Игнатий Мазонович и его брат Матфей пожертвовали своей приходской церкви колокол стоимостью 100 рублей серебром. В 1867 году те же прихожане пожертвовали 500 рублей. На эти средства, при участии и помощи священника Антония Станкевича, была устроена колокольня, возведена новая ограда вокруг церкви и построена новая крыша церкви. В 1873 году в церкви была построена новая ризница, на устройство которой местные прихожане пожертвовали 99 рублей. Крестьянин Мозонович пожертвовал в новую ризницу облачение из светлой парчи. За пожертвования и благоустройство своей церкви прихожане Попинской церкви получили архипастырское благословение. В 1886 году была сделана новая крыша и куплен новый колокол. Также в 1897 году на нужды Спасо-Преображенской церкви было прислано сто рублей протоиереем Иоанном Сергиевым (св. Иоанном Кронштадтским).
В книге «Описания церквей и приходов. Гродненский православный церковный календарь. Том 1», 1899 год, есть описание церкви в Попине.
Есть записи о православном духовенстве в Попине от Полоцкого собора до 1897 года. Стоит отметить, что Константин Статкевич перешёл из унии в православие.
Во времена II Речи Посполитой (1918-1939) есть карта, где отмечены колония Попина и церковь.
В настоящее время церковь имеет следующий вид: основной прямоугольный сруб церкви покрыт вальмовой крышей, которая в центре завершается луковичной главкой. С востока пристроена пятигранная апсида с боковой ризницей, с запада — прямоугольный притвор, над которым во второй половине XX века возведена двухъярусная четырёхгранная шатровая колокольня, увенчанная маковкой. Горизонтально обшитые боковые фасады расчленены лучистыми оконными проёмами и брусьями в перегородках. Средняя часть церкви перекрыта плоским потолком по балкам, апсида выделяется деревянным иконостасом. Церковь является памятником народного зодчества. Весной 1962 года Спасо-Преображенская церковь была закрыта. Богослужения в ней не проводились до 1989 года. 25 ноября 1989 года Спасо-Преображенская церковь была освящена благочинным Кобринского округа протоиереем Александром Лесиком.
В настоящее время церковь действует и находится в агрогородке Новая Попина, Дрогичинский район.